上海大学马克思主义学院前身是上海大学社会科学学院，最初成立于1994年11月，成为直属学校领导的独立二级机构，统一管理全校本专科、研究生思政课教学，统一负责马克思主义理论学科建设，统一管理思政课教师。2006年，上海大学获得“思想政治教育”二级学科博士学位授予权、“马克思主义理论”一级学科硕士学位授予权和“政治经济学”二级学科硕士学位授予权。2014年11月24日，上海大学2014年第十九次党委常委会决定，上海大学成立马克思主义学院。2015年，学院获批上海高校唯一的“马克思主义理论”高原学科，获批“全国高校思想政治理论课教学科研团队择优支持计划”。2017年获批上海市马克思主义理论高峰学科和上海市高校马克思主义理论智库，获得教育部“高校示范马克思主义学院和优秀教学科研团队建设项目（重点选题）”，马克思主义学科整体实力得到进一步提升。2018年参与申报国家级教学成果奖并获得一等奖，这些经验在上海市和全国得到推广。