上海大学生物医学工程专业创办于1979年，1984年获批一级硕士学位点。本学科是第一届教育部生物医学工程类教指委委员单位，并在高端医疗器械、医疗数字化与智能化领域强力支撑上海市“六五”至“十二五”发展规划。“十三五”期间，本学科在刘昌胜院士的带领下，进一步围绕上海市科创发展需要，新增生物医学材料、组织工程与再生医学方向，针对卫生医疗的重大需求和制约产业发展的关键技术问题，以医学影像设备、体外诊断设备为重点，加强数字诊疗设备共性技术研发，开发具有自主知识产权的通用核心部件、数字分析系统及生物医学材料，促进传统诊疗设备更新换代，建立数字诊疗设备技术标准体系，加快推动数字诊疗设备研发和产业化。截止2022年，本专业已经累计培养本科生700余人，硕士研究生200余人；学生毕业后大多进入联影、微创等上海市龙头医疗器械企业，极大支撑了上海市生物医药领域的产业升级。