应用物理学专业为学生提供开放式、一流的最优秀创造型人才成长平台，学生从大二开始便可进入教授团队参加前沿科学研究，可以利用整个物理系的教授团队和重点实验室等资源，支撑和鼓励学生参与各类学科学术竞赛、创新创业比赛和创新实践等。本专业实行全员导师制，以高水平的科研带动专业建设，与本系上海市高温超导重点实验室、量子与分子国际中心、量子人工智能国际中心等科研平台，以及市教委创新团队等深度融合，形成多渠道教学资源，在教学方式、专业内涵和拔尖人才培养等方面形成了很好的优势。
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